| 営業キロ | 営業キロ(駅間) | 駅名 | よみがな | 接続・備考 |
|---|---|---|---|---|
| 0.0 km | 五稜郭 | ごりょうかく | 函館本線 | |
| 2.7 km | 2.7 km | 七重浜 | ななえはま | |
| 5.3 km | 2.6 km | 東久根別 | ひがしくねべつ | |
| 6.5 km | 1.2 km | 久根別 | くねべつ | |
| 7.6 km | 1.1 km | 清川口 | きよかわぐち | |
| 8.8 km | 1.2 km | 上磯 | かみいそ | |
| 14.3 km | 矢不来信号場 | やふらいしんごうじょう | ||
| 17.6 km | 8.8 km | 茂辺地 | もへじ | |
| 22.6 km | 5.0 km | 渡島当別 | おしまとうべつ | |
| 27.5 km | 4.9 km | 釜谷 | かまや | |
| 30.6 km | 3.1 km | 泉沢 | いずみさわ | |
| 34.0 km | 3.4 km | 札苅 | さつかり | |
| 37.8 km | 3.8 km | 木古内 | きこない | 海峡線 |
| 営業キロ | 営業キロ(駅間) | 駅名 | よみがな | 接続・備考 |
|---|---|---|---|---|
| 37.8 km | 木古内 | きこない | 海峡線 | |
| 40.1 km | 2.3 km | 渡島鶴岡 | おしまつるおか | |
| 43.2 km | 3.1 km | 吉堀 | よしぼり | |
| 56.4 km | 13.2 km | 神明 | しんめい | |
| 59.2 km | 2.8 km | 湯ノ岱 | ゆのたい | |
| 66.3 km | 7.1 km | 宮越 | みやこし | |
| 68.5 km | 2.2 km | 桂岡 | かつらおか | |
| 70.6 km | 2.1 km | 中須田 | なかすだ | |
| 73.8 km | 3.2 km | 上ノ国 | かみのくに | |
| 79.9 km | 6.1 km | 江差 | えさし |